2021年12月，康九红课题组在EMBO Reports杂志上发表研究论文“LncRNA SOX1-OT V1 acts as a decoy of HDAC10 to promote SOX1-dependent hESC neuronal differentiation”。

神经元是神经系统最基本的结构和功能单位。在神经发育过程中，神经上皮细胞受到外界因子的诱导形成区域化的神经前体细胞，进而通过神经发生产生有功能的神经元。胚胎干细胞的神经分化可在体外模拟这一过程。基于干细胞神经分化系统，我们发现lncRNA SOX1-OT V1，无论是在背侧皮层分化，还是在腹侧MGE分化中，皆上调表达。抑制SOX1-OT V1既不影响hESC分化成为神经上皮细胞，也不影响其分化成为特定区域的NP细胞，但却不能进一步分化成为神经元。在3D分化系统中也显示抑制SOX1-OT V1不影响神经管样结构的形成，并且在背侧皮层分化中，在神经管外侧能够形成TBR2阳性NP细胞，却不能形成皮层神经元；而在腹侧MGE分化中， 在神经管外侧能够检测到NKX2-1阳性NP细胞的产生，同样也不能继续分化形成GABA神经元。机制研究发现，抑制SOX1-OT V1会导致转录因子SOX1基因组区域组蛋白乙酰化水平的降低而引起SOX1的表达下调。进一步发现，SOX1-OT V1能够通过其5’端与组蛋白去乙酰化酶HDAC10结合，充当了HDAC10的decoy，阻止了HDAC10在SOX1基因组区域结合而维持了SOX1基因组区域乙酰化水平，促进了SOX1的表达。继而我们发现，SOX1能够直接结合到ASCL1的启动子区，激活ASCL1的表达而促进神经元的发生。该研究将有助于我们更好的理解长链非编码RNA如何与表观修饰分子共同调控下游基因的表达，并进一步揭示人脑神经元分化过程中的调控机制。

奚佳捷博士、徐焱鑫博士和郭贞明博士为本文的共同第一作者，康九红教授为本文的通讯作者。该工作得到了科技部重点研发计划、国家自然科学基金委、上海市科委等项目的支持。