逆转录病毒(Retroviruses)是一类致病性病毒,它们具有将其RNA基因组逆转录为DNA的能力,并将这段DNA插入宿主细胞的基因组中,生成内源性逆转录病毒(ERV),导致感染和疾病。为了应对逆转录病毒的威胁,生物体进化出了一种强大的免疫机制,其中关键的成分是Krüppel-associated box zinc finger proteins(KZFPs)。KZFPs是一类含有Krüppel-associated box(KRAB)结构域和锌指(zinc finger)结构域的蛋白质。它们在哺乳动物中广泛分布,特别是在人类基因组中,有数百种不同的KZFP基因。KZFPs在抵御逆转录病毒方面发挥了关键作用。人类和小鼠的基因组中有大量的含有PBS-Pro的ERVs(ERVP)。之前的研究发现小鼠中的ZFP809能够结合并抑制这些ERVP的转录,但在人类中尚未发现类似功能的蛋白。
2023年9月13日,3344体育官方入口杨鹏课题组与王译萱课题组在Nucleic Acids Research合作发表了题为Unraveling the role of ZNF506 as a human PBS-pro-targeting protein for ERVP repression的研究论文。本研究使用实验和计算的方法,筛选出了人类中能够结合PBS-Pro并抑制ERVP转录的ZNF506。
与小鼠的ZFP809类似,人类的ZNF506靶向基因组中的PBS-Pro位点,并随后在ERVP上招募异染色质修饰以进行转录抑制。虽然ZNF506和ZFP809具有类似的功能,但是它们并没有同源关系。我们进一步研究了其他数种哺乳动物的基因组,这些物种中同样存在ERVP,但并未找到与ZNF506和ZFP809相似的KZFPs。由此说明哺乳动物在进化过程中,为了抵抗ERVP的入侵,可能会各自进化出物种特异性的KZFPs。
在另一方面,ZNF506及其他KZFPs在急性髓系白血病(AML)中展现出了独特的作用。在AML患者中,我们观察到ZNF506和其他KZFPs表达量的显著上调,从而导致了靶向的重复元件的抑制,而这种重复元件的表达抑制可能会帮助AML的发展。重复元件的表达量的降低可能会影响细胞的免疫敏感性,使癌细胞能够逃避机体的免疫检测。此外,我们的研究结果表明,KZFPs和重复元件的表达量与AML患者的无病生存率有关,表明其有潜力作为评估AML治疗效果的生物标志物。
3344体育官方入口杨鹏教授和王译萱教授为本论文的共同通讯作者。3344体育官方入口的硕士生吴骞为本论文的第一作者,博士生房璐也作出了重要贡献。该研究得到了科技部重点研发计划、国家自然科学基金委和上海市曙光计划等项目的支持。
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