姓名：张赫                                                  

学位：博士

导师情况：博士生导师

研究领域：表观遗传学、基因组学、肿瘤学

E-mail:zhanghe@tongji.edu.cn

联系电话：021-65981839

通讯地址：上海市3344体育官方入口四平路校区医学楼1207室

实验室网站：zhlab.tongji.edu.cn

研究方向：

染色质是生命活动所必需的遗传物质，具有高度的动态可塑性，在基因转录沉默和激活中起核心调控作用，也是许多重要生理和病理过程中的关键调控因素。本实验室利用表观遗传学、基因组学和肿瘤学的方法，采用干、湿实验结合的方式，以干细胞、肿瘤细胞等为研究对象，研究生命体重要生理和病理过程中染色质动态重塑的关键作用和表观遗传调控机制，特别关注染色质三维构象和染色质富集长非编码RNA的作用机制，相关研究对揭示基因转录调控、细胞命运改变和疾病发生的表观遗传机理，具有十分重要的科学价值和潜在临床意义。实验室研究方向包括但不限于以下方向：

1）印迹、干性和癌/抑癌等重要基因或lncRNA转录调控过程中，远端增强子、绝缘子调节的染色质三维构象形成机制与调控功能；

2）干细胞重编程、肿瘤细胞生长、转移与自噬等细胞命运改变过程中，染色质动态修饰的作用与机制；

3）常见和罕见恶性肿瘤发生发展的表观遗传发病机理和靶向治疗。

本实验室常年招聘副研究员、助理研究员和博士后，欢迎有兴趣的研究生和本科生报考和实习。

个人简介：

2009年博士毕业于上海交通大学医学院生物化学与分子生物学专业，其中2007年至2009年在斯坦福大学医学院表观遗传学专业完成博士联合培养。2009年至2012年在斯坦福大学医学院从事表观遗传学相关博士后研究。2012年底起到上海交通大学工作，历任上海交通大学医学院助理研究员、研究员、博士生导师，上海交通大学医学院眼科视觉科学研究所副所长等职。2018年春调任3344体育官方入口，历任生物医药与技术系副主任、党支书记、教授、博士生导师，井冈山大学校长助理（挂职）等职。 

张赫教授长期从事重要生理和病理过程中染色质动态重塑的关键作用和表观遗传调控机制。至今，以通讯作者在Cell Reports、Communications Biology、Nucleic Acids Research、Autophagy、Molecular Therapy、Genome Biology等期刊发表SCI论文21篇，以第一作者在Cell Stem Cell、Journal of Cell Biology等期刊上发表SCI论文6篇，其中包括3篇IF>20和12篇IF>10。主持国家重点研发计划项目、国家自然科学基金面上项目、上海市基础研究重点项目等课题12项；入选国家重点研发计划首席科学家、上海高校东方学者特聘教授、上海浦江人才计划、上海曙光学者、上海优秀青年医学人才、上海市青年岗位能手等人才计划和荣誉称号10项；主编本科教材2部，发表教学论文2篇，主持教学改革课题2项，主讲精品课程《高级细胞生物学》；以第一发明人授权发明专利3项；获国家科技进步二等奖2项、教育部科技进步一等奖1项、上海市科技进步一等奖3项；是科技部国家重点研发计划会评专家评审组成员、国家自然科学基金生命学部和医学部函评专家、教育部自然科学奖和科技进步奖函评专家；兼任中整协干细胞研究与应用分会青年工作委员会副主任委员等。

代表性论文（*通讯作者，#第一作者）：

1. TY Ding, JX Zhang, HW Xu, XY Zhang, F Yang, YB Shi, YR Bai, JQ Yang, CQ Chen, H Zhang*. In-depth understanding of higher-order genome architecture in orphan cancer. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2023,188948.

2. H. Pan#, H. Wang#, X. Zhang#, F. Yang#, X. Fan*, H. Zhang*. Chromosomal instabilityassociated MAT1 lncRNA insulates MLL1-guided histone methylation and accelerates tumorigenesis. Cell Rep. 2022,41:111829.

3. X. Wen#, T. Ding#, F. Li#, J. Fan, X. Fan*, R. Jia*, H. Zhang*. Interruption of aberrant chromatin looping is required for regenerating RB1 function and suppressing tumorigenesis. Commun Biol. 2022,5:1036. 

4. T. Ding, H. Zhang*. Novel biological insights revealed from the investigation of multiscalegenome architecture. Comput Struct Biotechnol J. 2022,21:312-325.

5.   Chai P#, Yu J#, Jia R#, Wen X#, Ding T#, Zhang X, Ni H, Jia R, Ge S, Zhang H*, Fan X*. Generation of onco-enhancer enhances chromosomal remodeling and accelerates tumorigenesis. Nucleic Acids Res. 2020, 48(21):12135-12150.

6. Li P#, He J#, Yang Z#, Ge SF, Zhang H*, Zhong Q*, Fan XQ*. ZNT1 long noncoding RNA induces autophagy to inhibit tumorigenesis of uveal melanoma by regulating key autophagy gene expression. Autophagy. 2020,16(7): 1186-1199. 

7.He X#, Chai P#, Li F#, Zhang L#, Zhou C, Yuan X, Li Y, Yang J, Luo Y, Ge S, Zhang H*, Jia R*, Fan X*. A novel LncRNA transcript, RBAT1, accelerates tumorigenesis through interacting with HNRNPL and cis-activating E2F3. Mol Cancer. 2020,19(1):115.

8.Fan JY#, Xu YF#, Wen XY#, Ge SF, Jia RB*, Zhang H*, Fan XQ*. A cohesin-mediated intrachromosomal loop drives oncogenic ROR lncRNA for accelerating tumorigenesis. Mol Ther, 2019, 27(12):2182-2194.

9.Chai P#, Jia R#, Jia R#, Pan H#, Wang S#, Ni H, Wang H, Zhou C, Shi Y, Ge S, Zhang H*, Fan X*. Dynamic chromosomal tuning of a novel GAU1 lncing driver at chr12p13.32 accelerates tumorigenesis. Nucleic Acids Res. 2018, 46(12):6041-6056.

10.Jia RB, Chai PW, Zhang H*, Fan XQ*. Novel insights into chromosomal conformations in cancer. Mol Cancer.2017, 16:173.

11.Xing Y# , Wen XY#, Ding X#, Fan Jiayan#, Chai Peiwei#, Jia RB, Ge SF, Qian GX, Zhang H*, Fan XQ*. CANT1 lncRNA triggers efficient therapeutic efficacy by correcting aberrant lncing cascade in malignant uveal melanoma. Mol Ther, 2017,25(5):1209-1221.

12.Fan J, Xing Y, Wen X, Jia R, Ni H, He J, Ding X, Pan H, Qian G, Ge S*, Hoffman AR, Zhang H*, Fan X*. Long non-coding RNA ROR decoys gene-specific histone methylation to promote tumorigenesis.Genome Biol, 2015, 16:139.

13.Zhang H, Zeitz MJ, Wang H, Niu B, Ge S, Li W, Cui J, Wang G, Qian G, Higgins MJ, Fan X, Hoffman AR*, Hu JF*. Long noncoding RNA-mediated intrachromosomal interactions promote imprinting at the Kcnq1 locus. J Cell Biol. 2014 Jan 6; 204(1):61-75.

14.Zhang H, Jiao W, Sun L, Fan J, Chen M, Wang H, Xu X, Shen A, Li T, Niu B,Ge S, Li W, Cui J, Wang G, Sun J, Fan X*, Hu X, Mrsny RJ, Hoffman AR*, Hu JF*.Intrachromosomal looping is required for activation of endogenous pluripotency genes during reprogramming. Cell Stem Cell. 2013 Jul 3;13(1):30-5

15.Chen M#, Zhang H#, Wu J#, Xu L, Xu D, Sun J, He Y, Zhou X, Wang Z, Wu L, Xu S, Wang J, Jiang S, Zhou X, Hoffman AR*, Hu X*, Hu J*, Li T*. Promotion of the induction of cell pluripotency through metabolic remodeling by thyroid hormone triiodothyronine-activated PI3K/AKT signal pathway. Biomaterials. 2012. 33(22): 5514-23.

16.Zhang H, Niu B, Hu JF*, Ge S, Wang H, Li T, Ling J, Steelman BN, Qian G, Hoffman AR*. Interruption of intrachromosomal looping by CCCTC binding factor decoy proteins abrogates genomic imprinting of human insulin-like growth factor II.J Cell Biol.2011.193(3):475-87.

17.Zhang H, Wang HB, Zhang JJ, Qian GX, Niu BB, Fan XQ, Lu J, Hoffman AR, Hu JF, Ge SF. Enhanced therapeutic efficacy by simultaneously targeting two genetic defects in tumors. Mol Ther, 2009. 17(1): p. 57-6

主持课题情况

1. 国家重点研发计划项目2017YFE9126300（首席科学家）

2. 国家自然科学基金面上项目31870748（主持）
   

3. 国家自然科学基金面上项目 31470757（主持） 

4. 上海市基础研究重点项目 14JC1404200（主持）
   

5. 上海市国际合作重点项目 14430723100（主持）

科技奖励情况

1. 国家科技进步二等奖，第七完成人，2018年

2. 国家科技进步二等奖，第六完成人，2015年

3. 上海市科技进步一等奖，第五完成人，2017年

4. 教育部科技进步一等奖，第二完成人，2014年

5. 上海市科技进步一等奖，第七完成人，2014年

6. 上海市医学科技一等奖，第七完成人，2014年

7. 上海市科技进步一等奖，第五完成人，2012年

8. 教育部科技进步二等奖，第五完成人，2012年

入选人才计划

1. 国家重点研发计划首席科学家，2019年

2. 上海市曙光计划，2017年

3. 上海卫生计生系统优秀青年医学人才，2017年

4. 上海交通大学医学院高峰学科-双百人计划，2016年

5. 上海市青年岗位能手，2016年

6. 上海高校特聘教授（东方学者），2014年

7. 上海交通大学晨星优秀青年学者，2014年

8. 上海交通大学青年岗位能手，2014年

9. 上海交通大学医学院九龙医学优秀青年人才，2014年

10. 上海市浦江人才，2013年

学术兼职

1. 中国整形美容协会干细胞研究与应用分会青年工作委员会副主任委员

2. 中国生物物理学会辐射与环境专业委员会青年委员

3. 中国研究型医院学会分子肿瘤与免疫治疗专业委员会委员

4. 中国妇幼眼保健专业委员会儿童眼肿瘤及遗传病学组委员

5. 中国医药生物技术协会精准医疗分会委员

6. 上海市青年科技人才协会委员