报告人：Hui Li, PhD 

 Associate Professor, Department of Pathology,

 University of Virginia. USA.    

主持人:  康九红 教授

时   间:   2016年11月4日上午10：30-11：30

地   点:  医学大楼1102室

Academic appointments

2015 – present: Associate Professor, Department of Pathology, University of Virginia.

2009 – 2015: Assistant Professor, Department of Pathology, University of Virginia.

2003 – 2009: Post-doctoral Fellow, Yale University

1998 – 2003: Ph.D. Case Western Reserve University

1993 – 1998: B.Sc. University of Science and Technology of China.

Background

        除了在癌症的情况下，基因及其产物（RNA和蛋白质）被认为不会混合。我们已经证明RNA反式剪切（trans-splicing）会产生嵌合融合RNA（chimeric fusion RNAs）。在有些情况下，正常细胞中会产生融合蛋白。在间充质干细胞分化过程中我们发现可以瞬时产生肿瘤标志性融合RNA和蛋白质，使用这些肿瘤标志物来追踪复杂癌症的细胞起源。除了反式剪接外，相邻基因之间的顺式剪接（cis-SAGe）是产生基因间剪接的嵌合RNA的另一种机制。通过操纵CTCF水平结合RNA-seq，我们发现了其他的顺式SAGe融合。为了研究嵌合RNA在正常生理学中的功能，我们分析了来自30例非癌组织和细胞类型（包括胚胎干细胞）样本的291个RNA-seq数据。发现超过10,000个融合RNA事件，涉及超过10％的人类基因组。我们创造了“融合组（fusionome）”这个词来描述这种现象。除了组织特异性融合，我们还发现一组融合无处不在地表达，沉默它们导致正常细胞生长和的运动性的显著减少。我们称之为“管家融合（house-keeping fusions）”。

Selected publications:

1. Jia Y, Xie Z, &Li H*. Intergenically Spliced fusion RNAs and their Implications inCancer. Trends in Cancer(in press)

2. Zhang Y, Gong M, …Li H*. Chimeric transcriptgenerated by adjacent genes cis-splicing regulates prostate cancer cell proliferation. Cancer Discovery 2012 Jul; 2(7):598-607. Epub2012 Jun 19. PMID: 22719019 (cover of the issue)

3. Li H, Wang J, Mor G, Sklar J. A neoplastic gene fusion mimics trans-splicing ofRNAs in normal human cells. Science, 2008; 321(5894), 1357-61. PMID:18772439 (Perspectives in Science. 321, 1302-1304; Comments in Nature Reviews Genetics 9, 734; Cell 135, 5)